近日，我校生命科學(xué)學(xué)院王占旗副教授與中國(guó)農(nóng)科院植保所/浙江大學(xué)周雪平教授團(tuán)隊(duì)和浙江大學(xué)李飛教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合構(gòu)建了雙生病毒-植物-昆蟲數(shù)據(jù)庫GPIBase（Geminiviridae-Plant-Insect Database），研究成果“GPIBase: A comprehensive resource for geminivirus–plant–insect research”正式發(fā)表于國(guó)際著名學(xué)術(shù)期刊《Molecular Plant》（中科院一區(qū)TOP，2021IF = 21.95，2022即時(shí)影響因子IF = 26.52）。

　　該數(shù)據(jù)庫共包括五大主要模塊：

　　1）“Browse”：包括雙生病毒、病毒宿主、病毒寄主以及病毒伴隨衛(wèi)星β信息的完整搜索與下載，同時(shí)詳情界面提供了全面的基礎(chǔ)與遺傳信息；

　　2）“Network”：將病毒-植物-昆蟲的互作關(guān)系通過網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)進(jìn)行可視化，直觀分析不同病毒、宿主和寄主的關(guān)系；

　　3）“Phylogeny”：基于雙生病毒全基因組序列比對(duì)，構(gòu)建了目前最為全面的雙生病毒科的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系；

　　4）“Tools”：提供了BLAST功能進(jìn)行病毒基因蛋白的比對(duì)與搜索；

　　5）“Literature”：及時(shí)更新雙生病毒相關(guān)的研究進(jìn)展，同時(shí)通過分析雙生病毒文獻(xiàn)作者，初步構(gòu)建了國(guó)際雙生病毒研究人員社區(qū)。該數(shù)據(jù)庫為雙生病毒的后續(xù)研究提供了便捷和重要基礎(chǔ)。

　　GPIBase提供了最完整的雙生病毒、病毒寄主信息、病毒媒介遺傳信息，病毒-植物-昆蟲互作信息以及多種在線工具，可實(shí)現(xiàn)相關(guān)文獻(xiàn)同步更新，并初步搭建了國(guó)際雙生病毒研究人員社區(qū)。

　　論文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1674205223000400

通訊員：姜露